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    BioSiS / Département Biologie, Signaux et Systèmes en Cancérologie et Neurosciences

    En cancérologie, un premier projet concerne l’identification de cibles moléculaires stratégiques. Face aux résistances thérapeutiques des cancers du sein métastatiques, ce projet vise à améliorer la prise en charge en prédisant l’échappement thérapeutique via la caractérisation des mécanismes moléculaires à l’origine de la régulation de l’activité des biomarqueurs notamment claudine 1, DDB2 et ERa36 et de leur gène codant.

    Le second projet concerne le domaine du théranostic en biophotonique dans lequel nous souhaitons que le laboratoire devienne un acteur majeur et clairement identifiable aux niveaux national et international. La biophotonique est l’application de l’optique à la biologie, dans le cadre de la recherche fondamentale, du diagnostic et de l’intervention biomédicale. C’est un domaine pluridisciplinaire qui relève de la photonique, de la biologie multi-échelle et de l’ingénierie (instrumentation, traitement du signal et des images, systèmes). Ce domaine de pointe, qui inclut toutes les techniques d’analyse optique des processus biologiques, connaît depuis quelques années un très fort développement soutenu par un ensemble d’avancées technologiques dans le domaine des lasers, dans le marquage fluorescent des biomolécules, des nanomédicaments et de l’instrumentation dédiée;

    Nous regroupons dans un projet unique autour des interactions rayonnements-tissus, les stratégies thérapeutiques que nous développons en nanomédecine et nos approches en photodiagnostic par l’entremise des méthodes de spectro-imagerie clinique (biopsie optique & imagerie panoramique multimodalités). Les objectifs sont d’obtenir une labellisation de la Ligue contre le Cancer et d’augmenter notre visibilité internationale.

    En neurosciences, les travaux autour de l’étude des mécanismes cérébraux de la reconnaissance visuelle chez l’Homme grâce à l’identification et à la localisation des réseaux cognitifs seront renforcés. Ces études bénéficieront de l’enregistrement simultané EEG de surface - EEG de profondeur (SEEG), avec la capacité d’enregistrer simultanément l’activité neurophysiologique du neurone unitaire (en collaboration avec Center for Systems Neurosciences - Leicester) qui est une spécificité du CRAN. L’approche par stimulation périodique rapide qui se concentre sur la fonction visuelle, est déterminante pour relier de façon intelligible les signaux enregistrés à différents niveaux d’organisation cérébrale et dans différentes modalités. Nous souhaitons ainsi progresser sur la modélisation numérique et biophysique multi-échelle en établissant des relations entre l’échelle cellulaire et l’échelle des populations de neurones. Des ressources locales indispensables en traitement du signal/image et modélisation, au sein du CRAN mais plus largement dans la Fédération Charles Hermite contribueront à cette réussite. Cette thématique de recherche pluridisciplinaire ouvre des perspectives de collaborations dans de nombreux domaines (neuropsychiatrie, maladies neurodégénératives, etc.).

    Ces projets en cancérologie et neurosciences bénéficient d’une activité de recherche méthodologique en traitement du signal et des images (séparation de sources, restauration d’images, etc.) avec notamment des applications en spectroscopie optique, spectro-imagerie et microscopie. Les thématiques principales concernent la régularisation parcimonieuse de problèmes inverses et les problèmes multidimensionnels, à savoir le traitement d’images hyperspectrales et les approches tensorielles.

    Projets de recherche / Membres
    Projets / Contrats

    EMMIE
    Endoscopie MultiModale pour les lésions Inflammatoires de l'Estomac
    [Lien ANR]

    ANR M3ODALITy
    Développement de nouveaux outils moléculaires pour l’imagerie TEP/NIRF
    [Lien ANR]

    ANR SEPICOT
    Etude du réseau épileptique à l'aide de l'automatique
    [Lien ANR] [Lien Projet]

    ANR TecSan - CyPaM2
    Cystoscopie Panoramique Multimodalités
    [Lien ANR] [Lien Projet]

    Prendre Votre Coeur en Mains
    [Lien FEDER]

    InnovaTICS Dépendance


    SpectroLive
    Dernières publications [+]
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    Merwan Ginet, Timothée Zaragori, Pierre-Yves Marie, Véronique Roch, Guillaume Gauchotte, Fabien Rech, Marie Blonski, Zohra Lamiral, Luc Taillandier, Laetitia Imbert, Antoine Verger. Integration of dynamic parameters in the analysis of 18F-FDopa PET imaging improves the prediction of molecular features of gliomas. European Journal of Nuclear Medicine and Molecular Imaging, Springer Verlag (Germany), 2020, 47, pp. 1381-1390  [+]
    Julie Dardare, Andréa Witz, Jean-Louis Merlin, Pauline Gilson, Alexandre Harlé. SMAD4 and the TGFβ pathway in patients with pancreatic ductal adenocarcinoma. International Journal of Molecular Sciences, MDPI, 2020, 21, pp. 3534  [+]
    Aliette Lochy, Christine Schiltz, Bruno Rossion. The right hemispheric dominance for face perception in preschool children depends on the visual discrimination level. Developmental Science, Wiley, 2020, 23, pp. e12914  [+]
    Kevin Litchfield, Stacey Stanislaw, Lisa Gallegos, Andrew Rowan, Desiree Schnidrig, Heidi Rosenbaum, Alexandre Harlé, Lewis Au, Samantha Hill, Zayd Tippu, Jennifer Thomas, Lisa Thompson, Hang Xu, Stuart Horswell, Aoune Barhoumi, Carol Jones, Katherine Leith, Daniel Burgess, Thomas B.K. Watkins, Nicolai Birkbak, Philippe Lamy, Iver Nordentoft, Lars Dyrskj?t, Lisa Pickering, Stephen Hazell, Mariam Jamal-Hanjani, James Larkin, Charles Swanton, Nelson?R. Alexander, Samra Turajlic, Chris Abbosh, Kai-Keen Shiu, John Bridgewater, Daniel Hochhauser, Martin Forster, Siow-Ming Lee, Tanya Ahmad, Dionysis Papadatos-Pastos, Sam Janes, Peter Van Loo, Katey Enfield, Nicholas McGranahan, Ariana Huebner, Sergio Quezada, Stephan Beck, Peter Parker, Henning Walczak, Tariq Enver, Rob Hynds, Mary Falzon, Ian Proctor, Ron Sinclair, Chi-wah Lok, Zoe Rhodes, David Moore, Teresa Marafioti, Elaine Borg, Miriam Mitchison, Reena Khiroya, Giorgia Trevisan, Peter Ellery, Mark Linch, Sebastian Brandner, Crispin Hiley, Selvaraju Veeriah, Maryam Razaq, Heather Shaw, Gert Attard, Mita Afroza Akther, Cristina Naceur-Lombardelli, Lizi Manzano, Maise Al-Bakir, Simranpreet Summan, Nnenna Kanu, Sophie Ward, Uzma Asghar, Emilia Lim, Faye Gishen, Adrian Tookman, Paddy Stone, Caroline Stirling, Andrew Furness, Kim Edmonds, Nikki Hunter, Sarah Sarker, Sarah Vaughan, Mary Mangwende, Karla Pearce, Lavinia Spain, Scott Shepherd, Haixi Yan, Ben Shum, Eleanor Carlyle, Steve Hazell, Annika Fendler, Fiona Byrne, Nadia Yousaf, Sanjay Popat, Olivia Curtis, Gordon Stamp, Antonia Toncheva, Emma Nye, Aida Murra, Justine Korteweg, Nahid Sheikh, Debra Josephs, Ashish Chandra, James Spicer, Ula Mahadeva, Anna Green, Ruby Stewart, Lara-Rose Iredale, Tina Mackay, Ben Deakin, Debra Enting, Sarah Rudman, Sharmistha Ghosh, Lena Karapagniotou, Elias Pintus, Andrew Tutt, Sarah Howlett, Vasiliki Michalarea, James Brenton, Carlos Caldas, Rebecca Fitzgerald, Merche Jimenez-Linan, Elena Provenzano, Alison Cluroe, Grant Stewart, Colin Watts, Richard Gilbertson, Ultan McDermott, Simon Tavare, Emma Beddowes, Patricia Roxburgh, Andrew Biankin, Anthony Chalmers, Sioban Fraser, Karin Oien, Andrew Kidd, Kevin Blyth, Matt Krebs, Fiona Blackhall, Yvonne Summers, Caroline Dive, Richard Marais, Fabio Gomes, Mat Carter, Jo Dransfield, John Le Quesne, Dean Fennell, Jacqui Shaw, Babu Naidu, Shobhit Baijal, Bruce Tanchel, Gerald Langman, Andrew Robinson, Martin Collard, Peter Cockcroft, Charlotte Ferris, Hollie Bancroft, Amy Kerr, Gary Middleton, Joanne Webb, Salma Kadiri, Peter Colloby, Bernard Olisemeke, Rodelaine Wilson, Ian Tomlinson, Sanjay Jogai, Christian Ottensmeier, David Harrison, Massimo Loda, Adrienne Flanagan, Mairead McKenzie, Allan Hackshaw, Jonathan Ledermann, Abby Sharp, Laura Farrelly, Hayley Bridger. Representative sequencing: Unbiased sampling of solid tumor tissue. Cell Reports, Elsevier Inc, 2020, 31, pp. 107550  [+]
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